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《欢乐颂》中的安迪该做什么基因检测

2017-08-08 20:01:50诺明基因微服务

周在威 
 


 


 

作者:周在威
遗传分析
    最近电视剧《欢乐颂》非常火,剧中安迪的妈妈及外婆都患有严重的精神疾病,而弟弟小明有严重的智力低下,虽然剧中描述安迪有46%的概率患有精神病,估计是按照常见疾病的风险评估算出,那么按照遗传病该如何分析呢,从家系患病情况来看比较像常染色体显性遗传模式,当然其他遗传模式也不能完全排除,比如线粒体遗传,特殊的隐性遗传,按照常染色体显性遗传分析,安迪有50%的概率患有该遗传病,那么如魏兄所说安迪已经30多岁已经排除了遗传病的可能呢?游侠认为不能简单地排除,因为有些遗传病确实是在一定的年龄后才会发病,小明的症状与妈妈及外婆的临床表型明显不同,是否排除了由同一个基因突变引起的呢?游侠认为遗传病具有异质性,即使相同的基因突变在每个人身上也会表现出不同的症状。
测序平台
    接下来该选什么测序平台呢?测序平台要根据用户的家庭情况考虑,鉴于安迪为国际大公司的CFO,年薪几百万,优先推荐全基因组测序,基因芯片不能筛查这类遗传病,全外显子测序可能漏掉大片段插入缺失,目前全基因组测序的成本仅为1000美元左右,关键是基因的数据分析,如果该部分价格降下来,即使是普通的工薪阶层也能消费得起。
候选基因
   测序完后后就要开始分析候选基因,根据突变位点分析是否与临床表型一致,鉴于我们没有真正地做测序,我们可以从临床表型出发,看看有哪些候选基因,在phenolyzer网站输入患者的临床表型schizophrenia(精神分裂症)与intellectual disability(智力障碍)得到如下基因关联图片
    我们可以点开某一个基因查看该基因跟两个临床表型的关联性,得分第一的AR基因其实与临床症状的证据并不充分,可以排除,排名第二的AKT1基因所引起的疾病与两个表型比较相符,同时我们点击该基因可以连接至NCBI,该基因为常染色体显性遗传,如果该基因有罕见的突变就要重点考虑,同理我们发现MECP2基因也为候选基因需要重点关注。
最后
    虽然欢乐颂的内容都是虚构的,游侠希望借此机会向大众科普遗传学常识及向医生朋友介绍phenolyzer网站如何定位遗传病候选基因,请大家多多扩散!!!