菠萝：基因测序报告成了读不懂的“天书”，怎么办？
如果你花钱请大仙算了一卦，但完事儿后，他不给你好好解卦，却直接丢给你一本根本看不懂的“解卦大百科全书”，让你自己去读，想不想骂人？
现在的基因测序服务经常就是这样。
基因测序，一个火得不行的词，不管是癌症病人，孕产妇，还是普通老百姓，都或多或少会接触到这个词。国内各种基因测序公司如同雨后春笋一般，刺溜一下就冒出来了。
基因测序本身是个非常好的东西，正在迅速改变大家的生活，我举双手双脚赞成靠谱测序的的应用推广，尤其是在癌症（比如遗传基因检测），优生优育（比如测罕见遗传病），和微生物学（比如感染诊断）。
癌症是目前基因测序的第一大市场。现在对很多癌症病人，尤其是乳腺癌、肺癌、直肠癌病人，基因检测几乎是必做的。
但无论什么应用，基因测序有个最大的问题：普通老百姓看不懂结果，必须请专业人士咨询指导。
但目前多数公司“管杀不管埋”，测序结果出来后直接丢一堆分析表格给顾客。很多客人看到结果后，开始恶补生物医学知识，最后仍是一知半解。
有人向我感慨：“菠萝，我真后悔当年高中生物课没好好上。”
为了让大家感觉好一点，我可以放心的说，即使你当年高中生物课好好上了，你还是看不懂。
要正确理解基因测序结果，必须要有长期的生物学，尤其是遗传学的训练。在咨询了一些基因测序结果以后，我发现，这也许是解决广大生物同学就业难题的好机会！
“21世纪是生物的世纪”，这句话把一群人忽悠进生物专业已经20年了，而这群人在寂寞中隐忍不言，就是在等大家看不懂基因测序结果的那一天。
基因测序结果长啥样？
癌症病人基因测序结果到底有多复杂？ 下面是一份我咨询过的肺癌基因测序报告的第1页（一共35页）：
能读懂的请举手！
有多少人拿到这个报告，放眼只看到了“肺癌”“基因”“药物”这几个词？
全外显子是啥？NCCN是啥？杂合多态性和纯合多态性是啥？ADH1B基因是啥？R337C突变是啥？非移码插入突变是啥？基因扩增1.8倍是啥？丰度是啥？
一句话，到底应该怎么治？
别说普通大众，很多医生或生物专业的人都不能完全搞懂这些玩意儿。
有人也许能一眼看到“EGFR基因，DdelinsDG第20外显子非移码插入突变（丰度44%）”是最关键的，其它很多信息对确定治疗方案并没有什么卵用。但这需要很多年的专业训练。
对于大众，这样一份35页的报告，如果没人解读，无异于天书。
有人可能会说，基因检测结果的读者其实应该是医生，而不是病人或家属，稍微复杂一点无所谓。但如果我花了1万多块钱，我还是希望能懂一些东西，不是么？何况，很多医生也搞不懂呢?
基因测序结果怎么读？
p53可是和癌症相关最重要基因之一。这下把mm吓坏了。
这突变是啥意思？mm心想先看看结果解释吧。不看不要紧，看完更晕，第3条说：“文献1到3说明Pro72Arg与乳腺癌风险具有显著相关性”，第4条说：“文献4到7说明Pro72Arg与乳腺癌患病风险无关”。
这不是自相矛盾么？有风险还是没风险？
mm打电话去给客服，客服说：“抱歉，我也不懂。”
菠萝拿到后，一时也不确定，去做了好一会儿功课。最后给mm解读了三点（前方高能预警：此处开始有大量专业词汇，只是为了严谨，读者可以跳过，直达下一部分）：
1：Pro72Arg根本就不算是突变，而是自然发生的“基因单核苷酸多态性（SNP）”。这个多态性，简单来说，就是指正常人群之中，有些人p53基因第72位是脯氨酸，有些人是精氨酸，但重要的是，无论哪种，都是正常蛋白，不是突变蛋白！这就像有些人是A血型，有些是B血型，虽然不同，但都是健康的。
2：报告里面的第3条和第4条显然是互相矛盾的，这说明研究论文里对Pro72Arg到底是否增加癌症风险没有定论。
基因相关研究中这类矛盾的结果非常多！那怎么判断哪边观点比较靠谱？
最安全的办法当然是去读那些论文。但如果读不懂呢？那就看文章发表时间！
比如这里，说Pro72Arg增加癌症风险的文章大多发表在2005年之前，而说它没有增加风险的文章则是最近10年的[1]。
请注意，一般来说，如果新旧研究论文水平类似，而且结论明显相反的话，菠萝会选择相信新文章！
原因有二，首先科学是不断进步的，新的知识和技术往往让研究更全面、完善、准确；另外新文章在发表之前，要经过专家审稿。如果新文章结论和以往的相反，作者必须提供大量证据来说服专业审稿人。新文章得以发表，说明专业人士认可新的研究结论，而旧的结论可能不准确。
3：即使相信Pro72Arg增加癌症风险，这位mm也是很安全的，因为她是杂合子，而不是纯合子。生物学上，人是二倍体，每一种基因都有两份，一份来自爸爸，一份来自妈妈。 杂合子的意思是说她只有一份基因是Pro72Arg，另一份还是普通正常版本。从研究文献来看，这风险是非常低的，具体就不展开了。
综合上面三点，我告诉这位mm：“别担心。”
靠谱的基因测序咨询师在哪里？
既然测序结果的解读如此重要，基因测序公司为什么不多雇一些专业人士做咨询师呢？
我能想到的有俩原因：第一，顾客群没有强烈要求，没必要去自我折腾，增加成本；第二，找不到合适的人。其中后者可能是主要原因：
1：“基因咨询师”这个行业在中国刚刚出现，公司很难找到有资质的人。
2：国内基因测序公司还在群雄混战阶段，老总们都在专心抢市场，后台基因咨询师不受重视，收入也不高，有这功夫，还不如去开滴滴呢。
因此，基因测序后的咨询，现在是市场上很大的缺口。但我认为同时也是很好的机会。有需求就有市场，最开始做好咨询客服的测序公司很可能积攒良好口碑，占领先机，成为测序界的“海底捞”。不做测序，而专注做专业基因咨询，也许有机会占领后期市场，并衍生出新产品，甚至垂直逆向整合。另外，对很多生物专业同学来说，也是一个值得关注的就业领域。
21世纪什么最贵？人才！
所以，请珍惜你身边每一位学生物的同学吧！
参考文献：
1： TP53 mutations in human cancers: origins, consequences, and clinical use.Cold Spring Harb Perspect Biol. 2010 Jan;2(1):a001008.
2：Role of a p53 polymorphism in the development of human papillomavirus-associated cancer.Nature. 1998 May 21;393(6682):229-34.
