分子育种专题年终盘点系列 | 基因标记验证解决方案
上回说到植物分子育种中，筛选百万级的基因标记需要用到基因组测序和SNP定制芯片，这两种方法适合于小样本量，百万级标记的筛选【分子育种专题年终盘点系列 | 基因标记筛选解决方案】。而当在利用高通量测序和SNP芯片的方式筛选出大量的性状相关的SNP位点后，通常会针对特定区域SNP位点，进行超大样品量验证。那此时，哪种方法更加准确、快速、性价比更高呢？
解决方案一AgriSeqTM 靶向测序
AgriSeqTM 靶向测序，基于Ion AmpliSeq技术，多重PCR的金标准，是市场上最灵活和可扩展的GBS技术；配套高通量自动化工作站，实现快速和有效的工作流程。相比于高通量SNP基因芯片，AgriSeq对于<5000个标记的基因分型更为有效，单个样本的成本更低，更高的样本通量，获得更多相关数据。
AgriSeq灵活，准确，通量高，周期短，性价比高；已证明广泛适用于各种作物物种；当然它不仅可以筛选验证已有位点，也可用作新标记发现工具。
案例展示
江汉大学研究团队利用AgriSeqTM技术开发水稻SSR基因分型应用，在8个水稻品种中鉴定到3,105个SSR标记，文章于2017年9月发表在Nucleic Acids Research上。
3,105个SSR应用指纹图谱构建中，远超过当前采用的48个SSR的国家农业标准；每两个水稻品种间的SSR平均为449.71个；用该技术很容易将Xa21基因mapping在SSR21附近，然而PAGE电泳的方式却未能检测到。
解决方案二IMAP
而当最终跟性状紧密相关的位点已锁定在1~300个核心标记上，需要对超大样本量进行检测或验证时，我们又有更优质的解决方案提供给各位老师。
博奥晶典根据国内种业需求，开发了国内首个具有自主知识产权的IMAP系统（微流控SNP芯片检测系统）。从芯片制备、扩增反应、芯片扫描到分型软件，为基因分型提供一整套简便易行的解决方案，提取样品基因组DNA后，可在2.5小时内轻松完成样品SNP分型的检测，从而实现低成本、快速、灵活的SNP分型，尤其适用于应用型芯片产品开发生产。
IMAP系统具有操作简单、快速、节约、持续更新的特点，目前已与多家单位合作开发多款应用型芯片，也成功完成了多种物种的分型检测。
总结
目前基因组学技术在分子育种领域主要应用方向是分子标记辅助育种，传统的育种存在周期长，盲目性大等劣势，而通过基因组学技术可以大大改善这些劣势，育种中伴随着研究标记数量的发现、筛选、验证的过程，我们针对每个阶段介绍了相应的基因组学技术和平台，包括10X Genomics基因组测序、SNP定制芯片、AgriSeq靶向测序、IMAP等。
目前可以说是生物技术飞速发展的时代，单细胞测序技术、基因编辑技术和人工智能技术等都推动着分子育种向分子设计育种阶段跨越。博奥晶典也会不断地研发和引进最新的科学技术，为分子育种事业助力。
博奥晶典科研服务事业部 李超、李楠、李媛媛 | 文案
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