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ALK基因突变的三六九:靶向药物有效时间真有差别

2018-02-10 14:00:51癌度

非小细胞肺癌中的肺腺癌是靶向治疗比较多的癌种类型,其中ALK基因突变在这个癌种类型中比例是5%-8%,未吸烟、女性和年轻的肺癌患者,往往这个基因突变频率比较大。

癌度前几天做了一期直播,讲述了:《癌战》里的抗癌英雄是真实的还是虚构的,大家一块温习了ALK基因阳性突变的肺癌的治疗。天高月黑的那天,我讲述了很多秘密的干货,您可以从微信号知识店铺进去观看回放。

同样是ALK基因突变,为何有的病人克唑替尼可以吃很久,而有的病人很快耐药了?ALK基因突变也会有三六九等吗?癌度今天的这个文章就给您编译一条《lung cancer》的文献。

我简单概述下ALK这个基因,关于更详细的信息,建议您听上面的抗癌故事去学习。

ALK基因是间变性淋巴瘤激酶,该基因中中间断开为两截,与EML4等其他基因融合,成为了一个ALK-EML4融合基因,驱动细胞恶性增殖失控。一般治疗的药物是一代克唑替尼、AP26113、色瑞替尼、艾乐替尼和劳拉替尼(3922)

但是一直被大家忽视的是,ALK基因可以与EML4之外的其他基因也发生融合,即便是ALKEML4发生融合也有不同的融合位点,形象地表述来说两者接头做坏事,交接的地方不同就可能导致对靶向药物应答的时间不同。

这项研究入组了96名ALK阳性突变的晚期肺腺癌病人,都使用了克唑替尼治疗。其中60名病人使用二代基因测序技术评估了ALK的变体形式。也就是ALK跟谁形成了融合基因?在哪个位置两个基因发生了融合?

如上图所示,60名ALK阳性可评估的肺癌患者,59名是腺癌,1名是鳞癌。ALK基因最常见的融合伴侣基因是EML4,49名病人是EML4ALK发生融合,占比是81.67%。其他的融合伴侣基因是KLC1、EPS15、PRKARIA,占比是18.33%。“ALK-EML4融合”的病人与“非ALK-EML4融合”的病人,两类人在无进展生存时间和对克唑替尼治疗应答率上没有显著区别。

EML4ALK中最常见的突变亚体是3a/b,占比是三分一左右(33.34%)EML4-ALK突变体1和突变体2分别占比23.33%15%EML4-ALK融合的罕见类型和非EML4-ALK的类型占比10%18.33%。60名患者的中位无进展生存时间是14.1个月。

为什么要将ALK基因分为那么多类别呢?这是有道理的,请看上面这个图,ALK-EML4的第2型的突变体使用克唑替尼获益最好,20个病人的平均无进展生存时间PFS是34.53个月。其他类型的突变亚型都是十几个月左右,跟这个是没有办法比较的。

我们将EML4-ALK的不同变体单独拿出来比较,仍然可以看到这里的趋势是很明显的。

如上图所示,V1与非V1变体,V3与非V3变体的无进展生存时间都差别不大,但是EML4-ALK的V2变体与非V2变体的无进展生存时间是区别的很开的。这个就是差距。另外该研究也表明,如果患者存在TP53突变,则使用克唑替尼时的无进展生存期也较短。

事情讲到这里并没有结束,现在需要回答大家一个问题,怎么判断病人的ALK融合基因突变是不是V2亚型啊,这个一定是需要做二代基因检测才能分辨出来的,使用免疫组化、原文免疫荧光杂交(FISH)只能判断是有ALK发生融合,但是判断不出来ALK的突变亚型。

如上图所示EML4-ALK的V2亚型,EML4的基因片段更长,不过它的融合位点与V1看起来似乎是一样的。

究竟如何判断ALK-EML4的融合突变形式是V2还是非V2型的,请打电话给负责基因检测的公司产品经理或技术支持,他们负责做这个工作。

而且也只有基因公司的技术人员可以分析得出来,因此选购基因检测产品的时候,您甚至可以给他们看这个文章,询问他们是否可以分辨ALK突变的亚型,这也算是他们技术能力的一个评估指标。