Cell观点质疑GWAS：将疾病完全归结于核心基因突变真的对吗？
| 导读 |
几十年来，现代生物学研究一直建立在全基因组关联分析（GWAS）基础之上。科学家们相信，发现疾病背后的基因突变，就能寻找到治疗疾病的方法。然而，近日发表于Cell上的一篇观点文章对这种做法却提出了质疑。 |
虽然核心基因在某种特性或疾病中扮演着重要角色。但是，基因不能孤立工作。它们在巨大的基因网络中相互影响，所以，“如果一个突变改变了任何一个基因，那么它可以改变整个基因网络。”Boyle说。他认为基因网络的关联十分强大。基本上任何基因变化都有可能波及到与特定性状有关的核心基因。
斯坦福大学的三位科学家将其称为“omnigenic model”。简单来说，他们认为大多数基因对大多数事情都很重要。
更具体地说，这意味着在特定类型的细胞——例如神经元或心肌细胞中开启的所有基因——可能涉及到这些细胞所具备的每种复杂特性。比如，几乎所有在神经元中开启的基因都会影响一个人的智力，痴呆风险或学习倾向。其中一些基因可能是主角，另一些可能只是配角。但是很少有基因会完全被遗漏在这个系统之外。
这或许能够解释为何搜寻复杂性状背后的遗传变异是如此艰巨。例如，一项大型研究考察了25万人的基因组，并确定了影响我们身高的700种突变。如预料的那样，每个基因都有一个微小的影响。但是，这些基因并不能完全的解释身高突变。Pritchard的团队重新分析了研究数据，并计算出可能有超过100,000种突变影响我们的身高。其中大多数基因的影响非常微小，很难将它们与统计学噪音区分开来，因此遗传学家通常会忽视它们。然而，Pritchard的团队指出，许多这些微弱的信号在不同的研究中一致出现，这表明它们确实有影响。
通过分析其他类似类风湿关节炎，精神分裂症和克罗恩病的大型遗传学研究，该小组找到了更多omnigenic model的证据。这些研究确定的许多突变似乎与所涉疾病有关。例如，一些精神分裂症突变影响参与神经系统的基因。但是，大多数情况下，这些突变影响的基因并不一定参与某些具体的功能，它们的影响是非常通用的。根据omnigenic model，这些基因只是通过影响关联性更强的核心基因，以偶然的方式造成疾病的风险。
Pritchard的观点对遗传学领域有很大的影响。如果Pritchard是正确的，那就意味着，大多数突变并不能给我们提供疾病相关的线索，通过GWAS来认知疾病或许并非良策。
